O Centro de Biociências do Instituto Superior de Psicologia Aplicada (ISPA) e a Câmara Municipal de Santarém celebraram dia 29 de Maio de 2009 um protocolo de cooperação que tem por objectivo o estabelecimento de acções de colaboração com vista à reabilitação do Rio Alviela, e que pretende constituir um modelo para a gestão global dos cursos de água do concelho de Santarém.

Trata-se de um protocolo pioneiro por reunir os esforços de uma instituição dedicada à investigação de espécies ameaçadas e de uma autarquia empenhada na protecção e reabilitação do rio Alviela, cuja equipa do Ambiente tem desenvolvido vários projectos de carácter pioneiro, integrados no Plano Municipal Estratégico para Reabilitação do rio Alviela – Uma Missão Local em direcção ao Desenvolvimento Sustentável.

No âmbito do protocolo celebrado, o Centro de Biociências participará activamente em várias acções de conservação dos cursos de água e dará prioridade à investigação aplicada à conservação das espécies aquáticas, monitorizando o estado das populações e caracterizando a sua diversidade genética.

Na sub-bacia hidrográfica  do rio Alviela ocorrem espécies ameaçadas como:

•  A boga portuguesa (Iberochondrostoma lusitanicum), espécie considerada criticamente em perigo de extinção,
• O escalo (Squalius pyrenaicus) e a enguia (Anguilla anguilla) considerados em perigo
• O Bordalo (Squalius alburnoides) considerado vulnerável, de acordo com o Livro Vermelho dos Vertebrados de Portugal.